Els objectius principals de l'ENS són els següents:
Crear les condicions necessàries de seguretat en l'ús dels medie electrònics, a través de mesures per a garantir la seguretat dels sistemes, les dades, les comunicacions, i els serveis electrònics, que permeta l'exercici de drets i el compliment de deures a través d'aquests mitjans.
Promoure la gestió continuada de la seguretat.
Promoure la prevenció, detecció i correcció, per a una millor resiliència en l'escenari de ciberamenaces i ciberatacs.
Promoure un tractament homogeni de la seguretat que facilite la cooperació en la prestació de serveis públics digitals quan participen diverses entitats. Això suposa proporcionar els elements comuns que han de guiar l'actuació de les entitats del Sector Públic i dels seus proveïdors tecnològics en matèria de seguretat de les tecnologies de la informació.